吴天祐，字吉甫，浙江绍兴府馀姚县人，民籍。弘治五年（1492年）壬子科浙江乡试第十六名举人。弘治六年（1493年）联捷癸丑科三甲第一百零五名进士。弘治八年（1495年）任福建松溪县知县。