吴允谦（1612年12月21日—1665年），字凝之，号玉京，成都府内江县人，明末清初政治人物。吴允谦在崇祯九年（1636年）中举人，次年（1637年）联捷进士，曾前往贵州主持乡试；弘光年间与赵东曦、朱邦祈、丁圣时、王运熙、宣国柱、胡周鼒同时召用，获授吏科给事中，其后隐居在淮安数年。江南巡抚上请清朝朝廷，让他补任口北道道员，转任洮岷道，在任内去世，有诗文数卷流传；弟弟吴允震、族子吴嵩、吴芳、吴龄等人先后中举，人称当地望族。