沈在宥（16世纪—1630年代），字元韬，号巢云，湖州府长兴县人，明朝、南明政治人物。沈在宥原名沈永明，是万历四十六年（1618年）的举人，到崇祯七年（1634年）成进士，八年获授工部虞衡司主事，九年管理盔甲厂，升郎中，转任漳州知府，有廉正名声。当时海盗藉驱除贪污为名掠夺居民，他警告对方切勿侵犯；升任兴泉道参议，独身上路时病重，对役夫说：「我对漳州人民无德，不要用后事连累。」过境后就去世了。