佘昌祚，四川重庆府合州铜梁县人，同进士出身。万历四十七年（1619年）己未科第三甲进士，授兴化府推官，天启元年（1621年）本省同考。崇祯元年四月考选，授刑科给事中，历官都给事中，以忤王永光，外转顺德府知府。父进士佘自强。