吴鲲，字君南，浙江杭州府仁和县人。万历十六年（1588年）戊子科浙江乡试举人，三十二年（1604年）甲辰科进士，兵部观政，三十三年秋授湘潭县知县，三十五年调武昌知县，丁忧，三十六年除铜陵知县，三十八年考察免官。