曹尔祯，字纪元，号纯原，直隶兴州后屯卫官籍，苏州府长洲县人。万历十九年（1591年）辛卯科顺天乡试第九名举人，万历二十六年（1598年）戊戌科进士，擢工部主事，历员外郎，升山西副使兼右参议。三十九年以乞终养归，四十六年起升山东参政。天启元年复除山东参政，三年以平白莲教之乱，升按察使。历左右布政使，五年升山西巡抚，曾在山西五台山为魏忠贤建生祠。天启七年二月，升为户部右侍郎。八月以三大殿工成加恩，改户部尚书，仍加太子太保。崇祯元年二月免官归。