王国祯，字子开，陕西西安府咸宁县（今陕西省西安市）人。万历二十三年（1595年），登进士，历任临晋、乐亭、遵化三县令，三十五年八月授山东道监察御史、巡按直隶等地，万历四十一年二月，宣城县生员梅振祚、梅宣祚等强奸官宦人家媳妇徐氏，被生员芮应元、芮永缙等所举发，巡按御史王国祯劾奏捕治，梅家贿赂官员，久不结案。万历四十六年七月，升授顺天府丞。天启元年（1621年），任通州巡抚、右佥都御史。次年，任宣大总督，授兵部右侍郎，后改左侍郎。