顾允元（1551年—？），字懋善，号凤山，直隶苏州府昆山县人。隆庆元年（1567年）丁卯科应天乡试十八名，万历十四年（1586年）丙戌科会试八十九名，登三甲第六十四名。礼部观政，任福建瓯宁县知县。