余乾贞（1533年—？），字秉智，浙江严州府遂安县人，民籍。隆庆元年（1567年）丁卯科浙江乡试第五十七名举人。隆庆二年（1568年）联捷戊辰科会试第二百七名，三甲第一百四十八名进士。隆庆五年九月选授云南道试监察御史，查刷光禄寺。万历元年（1573年）正月奉命清解北直隶、河南蓟镇逃军及各卫应改蓟镇者，八月条陈清理军玫八事。后以事贬江浦县知县，万历十年正月与南京兵部郎中刘学朱因考察彼此揭辩，二人同被褫职闲住。