邵元哲（1530年—？），字晦之，号古愚，贵州普安卫军籍，应天府上元县人。贵州乡试第二名举人。嘉靖四十四年（1565年）乙丑科会试八十三名，廷试第二甲第四十二名进士。刑部观政，授户部主事，升郎中。复除本部，历官淮安府知府，万历五年（1577年）十二月升山东济宁副使，专督河工，八年八月升云南右参政，十年七月调浙江。降职为副使，调用，卒。