钟继元，字仁卿，浙江嘉兴府桐乡县人，民籍。浙江乡试第五十六名举人。嘉靖四十一年（1562年）中式壬戌科会试第六十二名，三甲第一百三十一名进士。授江西安福县知县，擢刑部主事，升员外郎，出任广东按察司佥事，调任湖广。精通易经。