吴一琴（1536年—？），字子清，直隶广平府成安县人，民籍。嘉靖三十四年（1555年）乙卯科顺天府乡试第一百二十三名举人。嘉靖四十一年（1562年）中式壬戌科会试第二百十八名，三甲第十九名进士。