应存卓（1531年—？），字从之，浙江台州府仙居县人，民籍。浙江乡试第九十名举人。嘉靖三十八年（1559年）中式己未科会试第一百十八名，二甲第六十一名进士。历官刑部郎中，隆庆二年（1568年）八月升广西按察司副使，万历十一年（1583年）五月降贵州布政司左参议，十二年十二月升本省副使，迁云南左参政。十五年四月起补广东左参政，被吏科张鼎思弹劾不称职，十六年六月被调用。复官四川左参政，二十一年正月升贵州按察使，二十二年四月升广东右布政使。二十六年六月复除河南右布政使，八月迁贵州左布政使。