毛惇元（1525年—？），字裕仁，号春台，浙江绍兴府馀姚县（今馀姚市）人，民籍，榜眼及第。嘉靖三十一年（1552年）壬子科浙江乡试第三十七名。嘉靖三十八年（1559年）己未科会试第三名，殿试中式第一甲第二名进士。授翰林院编修。卒于任上，后事不详。