祝乾寿，字以仁，一字健卿，号斗南，湖广德安府应城县人。嘉靖三十二年（1553年），登癸丑科三甲第一百五十四名进士。户部观政，授南直隶昆山县知县，嘉靖三十六年（1557年）起复补直隶曲周县。嘉靖三十八年（1559年）九月考选，授山东道试监察御史。三十九年三月实授。