包应麟（1518年—？），字子瑞，浙江台州府临海县人。嘉靖十六年（1537年）丁酉科浙江乡试第五十名。嘉靖二十九年（1550年），登庚戌科二甲第四名进士。授工部主事，督漕河工程，出为太平府知府，嘉靖四十年（1561年）官广东广州府知府。