吴伯亨（1496年—？），字子贞，陕西兰州人，嘉靖壬辰进士。嘉靖十一年（1532年）壬辰科进士，历任吉安府推官，升任吏部考功司主事，改选验封司员外郎。嘉靖二十一年（1542年），升任吏部文选司郎中。当时大学士翟銮为礼部主事张惟一求吏部，严嵩为监生钱可教求东阳知县，俱书抵到王与龄处。王与龄与员外郎吴伯亨，主事李大魁、周鈇，一同告诉尚书许赞，并呈奏疏。当时嘉靖帝器重严嵩，于是指责许赞，并除名王与龄，吴伯亨等人外调。当时给事中周怡论救，被廷杖系狱。御史徐宗鲁等进言，皆被夺俸禄。自此，各司官员以王与龄为戒，不再敢与严嵩对抗。