吴大有，字元亨，直隶昆山县人，应天府上元县匠籍。弘治五年（1492年）壬子科应天府乡试第三名举人。弘治九年（1496年）中式丙辰科二甲第三十四名进士。授邓州知州，擢刑部员外郎、郎中，出为东昌府知府，改任两浙盐运使。正德十一年九月升任江西布政司左参政。