余琦（1445年—？），字世徵，福建兴化府莆田县人，民籍。进士出身。早年出身平海卫学生，福建乡试第三十五名举人。成化十一年（1475年）登乙未科第三甲第二名进士。历江西按察司佥事，丁忧去职。服阙，改浙江按察司佥事。弘治九年考察，勒令冠带閒住。