黄其晟（？—17世纪），原名黄仲晔，字芝仲，号平墅，又号元眉，福建泉州府同安县人，明朝、南明政治人物。黄其晟是万历四十三年（1615年）乙卯科十三名举人，天启二年（1622年）成进士，户部观政，本年担任内阁中书，七年任顺天同考，授广东道监察御史，崇祯元年（1628年）巡视东城，又巡青。二年巡视陕西茶马，三年出为江西抚州府知府，四年丁忧归。十年起补南昌府知府，奉旨改名其晟。十六年补任桂林府知府，升广西南宁道副使，任内有德政。永历帝继位，让黄其晟升任工部右侍郎；永历二年（1648年）正月，他和蔡世承一同出任兵部左侍郎及右侍郎，但未赴官。之后他跟随永历帝到缅甸，被清朝军队抓拿入狱六年，回乡后去世。