赵昌运（1583年—？），字五期，号瓦亭，陕西西安府临潼县人。万历三十四年（1606年）丙午科陕西乡试举人，万历三十五年（1607年）丁未科进士，户部观政，本年六月授四川铜梁知县，三十八年调榆次县，四十六年升礼部主事，天启五年六月山西道御史刘弘光纠劾其为门户党邪，被削籍为民。