吴应明（1557年—？），字仲卿，号怀溪，直隶徽州府歙县人，民籍，万历丙戌进士。万历七年（1579年）己卯科举人。万历十四年（1586年），登进士第三甲第二百十名。户部观政，授江西安福县知县。万历二十年（1592年）十月，选授户科给事中。二十一年八月升兵科右给事中，巡视京营，二十二年二月升户科左，六月与编修吴道南典试浙江，九月迁工科都给事中。建言国本，二十三年进太常寺少卿。给假奉母归里，数年卒。