第五节　元
从各类历史文献资料来看，黄鹤楼在元代有存世依据，但最终毁于元明之际兵火。
元至元八年（1271），忽必烈改蒙古为大元，定都北京。至元十一年（1274）命伯颜为统帅率十万大军挥师南下，自襄阳顺汉水长驱直下，又从鄂州下游的阳逻堡打开缺口，顺利渡过长江天险。元军曾用火攻将宋军战舰三千余艘化为灰烬，汉阳、鄂州相继以城投降，临安因此失去屏障。至元十六年（1279），南宋小朝廷在三年的颠沛流离之后覆灭，元朝完成了规模空前的大一统。忽必烈在灭亡南宋的过程中，建立了新的行省制度。湖广行省幅员甚为辽阔，大体包括今日湖北南部，湖南、广西和贵州的大部分地区以及广东的部分地区和海南岛。至元十四年（1277）设置鄂州路总管府，大德五年（1301）改武昌路。宋代的鄂州州城此后便正式称作武昌。武昌城作为湖广行省的省级治所、武昌路的路级治所和江夏县的县级治所，至此全面确立大区域中心城市的地位。
至元三十年（1293），陈孚奉命出使安南，武昌是其往返必经之所，途中所作《交州稿》中有两首黄鹤楼诗，一首是《黄鹤楼歌》，以夸张语言描绘了黄鹤楼的雄伟之姿和浪漫传闻；另一首是《鄂渚晚眺》，描绘了诗人在黄鹤楼上前观木叶秋黄、仰视大雁白云、俯听江中橹声、远眺汉阳灯影的登楼感受，诗题又作《登黄鹤楼》。从诗题与诗句来看，这两首作品均为陈孚亲自登楼有感而发，并非想象之作。而从郝经写《黄鹤楼》及《水龙吟》词到陈孚出使，期间仅过去二三十年，若黄鹤楼在宋元之际的战火中被毁，之后当有重建经历，但目前尚无任何史料可以证明黄鹤楼在元初有过重建，由此推测陈孚所登黄鹤楼应为宋末旧制，历宋入元。
除郝经、陈孚外，元人书写或提及黄鹤楼者不少。例如冯子振（1253—1348）《题黄鹤楼》：“鹤楼千尺倚晴岚，大别山头舞峻鸾。昨日英雄无问处，依然江汉涌波澜。”青年时代的揭傒斯（1274—1344）大德初曾漫游江汉，因受到湖北宪使司徒程钜夫的赏识而娶其从妹，在武昌居住过一段时间，期间常与武昌友朋登临黄鹤楼、遥望鹦鹉洲，多年后作过一首《梦武昌》：“黄鹤楼前鹦鹉洲，梦中浑似旧时游。”音韵学家周德清（1277—1365）在庐山送友人赴鄂州时也作过一首《蟾宫曲·送客之武昌》：“自在庐山，君游鄂渚，两地相思。白鹿洞谁谈旧史，黄鹤楼又有新诗。”便是以白鹿洞代指庐山，黄鹤楼代指武昌。另外，元代还出现过很多以黄鹤楼为题材的绘画作品，如刘诜《和龙麟洲题黄次翁黄鹤楼图》、释大圭《题黄鹤楼图》、夏永界画《黄鹤楼图》，这些诗画作品都为元代黄鹤楼存世留下若干旁证。
元代统治时间虽只百年左右，却在黄鹤楼附近留下重要一景，这就是今天黄鹤楼公园内保存最完整、最古老的单体建筑——胜像宝塔，俗称白塔。元泰定帝登基（1324）后，将武昌封给元世祖第四子脱欢的儿子威顺王宽彻普化，并设立了元代封国——威顺王国。宽彻普化坐镇武昌期间横行不法，侵夺民利，建广乐园以汇聚名倡巨贾。胜像宝塔即为园中一景，该塔建于至正三年（1343），是一座西藏佛教密宗的佛塔，主要用于供奉舍利、安放佛物，位于黄鹤楼正前方，更临近江面。此前黄鹤楼是武昌城头最瞩目的建筑，此后胜像宝塔与黄鹤楼一前一后立于矶头，风格迥异，却并存数百年。藏传佛教的萨迦派在元代被尊崇为国教，这也是佛教从印度传入中国最初的塔型。胜像宝塔的存在记录了异域宗教塔型传入内地的过程，也从侧面反映出元代统治者的民族政策和文化政策。
元代黄鹤楼毁于元末农民起义。至正二十三年（1363）秋，陈友谅和朱元璋在鄱阳湖大战，陈死于流矢，太尉张定边将陈友谅的尸体运回武昌并安葬在黄鹤楼附近，并立陈友谅之子陈理在武昌登基。朱元璋派大将徐达西征陈理，徐达屯兵于沌口，当时军中有一位进士汪广洋，于交兵之际仍想一登黄鹤楼，但不久便被调回建业，留下《癸卯秋，大军围武昌，予极欲一登黄鹤楼，不数日复命还建业，莫遂所怀，乃赋七言以寄予兴》一诗，从诗题和首句“武昌城头黄鹤楼”可知，当时黄鹤楼尚在。至正二十四年（1364）二月，朱元璋亲自兵临武昌城下，与沌口徐达联手猛攻鄂州，战斗激烈，伤亡惨重，最终陈理见大势已去，肉袒出降，鄂州、汉阳遂为朱元璋占有。据明初方孝孺所记，“元末诸侯相持”之时，武昌一片“颓城败垒”，连“求尺木寸垣”都不可得。黄鹤楼便在这场乱战中灰飞烟灭。